pcr是什么意思
聚合酶链式反应。
聚合酶链式反应 (PCR) 是一种基本的分子生物学技术,可准确扩增和量化极低水平的核酸,目前用于多种应用,包括 SNP 鉴定、基因分型、传染病鉴定、遗传指纹图谱、DNA 测序和克隆,以及基因表达。定量 PCR (qPCR) 和逆转录 (RT-qPCR) 以及随后的 qPCR 是检测和定量目标 DNA 或 RNA 序列的强大方法。
扩增子纯化和 PCR 设置,包括主混合物、引物和样品的费力移液组合,可能成为基因组工作流程中的瓶颈。这些过程的自动化可以消除与手动处理相关的人为错误和污染,同时确保高质量的结果。
测定小型化时,需要搭配PCR封板膜,这样既降低了 96 孔和 384 孔 qPCR 检测的成本,并且由先进的反应仪器不需要吸头或与液体接触,因此将交叉污染的风险降至最低。此外,亚微升体积的精确转移使得无需事先稀释即可添加浓缩样品和试剂。借助为基因组研究量身定制的集成板处理自动化和软件选项,仪器可以轻松扩展以适应生产环境
PCR反应中有两条引物,即5′端引物和3′引物。设计引物时以一条DNA单链为基准(常以信息链为基准),5′端引物与位于待扩增片段5′端上的一小段DNA序列相同;3′端引物与位于待扩增片段3′端的一小段DNA序列互补。
引物长度:15-30bp,常用为20bp左右。
引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C 过多易出现非特异条带。ATGC最好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列参照。
引物内部不应出现互补序列。
两个引物之间不应存在互补序列,尤其是避免3 ′端的互补重叠。
引物与非特异扩增区的序列的同源性不要超过70%,引物3′末端连续8个碱基在待扩增区以外不能有完全互补序列,否则易导致非特异性扩增。
引物3‘端的碱基,特别是最末及倒数第二个碱基,应严格要求配对,最佳选择是G和C。
引物的5′端可以修饰。如附加限制酶位点,引入突变位点,用生物素、荧光物质、地高辛标记,加入其它短序列,包括起始密码子、终止密码子等。
PCR的模板可以是DNA,也可以是RNA。
模板的取材主要依据PCR的扩增对象,可以是病原体标本如病毒、细菌、真菌等。也可以是病理生理标本如细胞、血液、羊水细胞等。法医学标本有血斑、精斑、毛发等。
标本处理的基本要求是除去杂质,并部分纯化标本中的核酸。多数样品需要经过SDS和蛋白酶K处理。难以破碎的细菌,可用溶菌酶加EDTA处理。所得到的粗制DNA,经酚、氯仿抽提纯化,再用乙醇沉淀后用作PCR反应模板。
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